مودیانی که از معافیت مالیاتی صدور صورتحساب الکترونیکی استفاده می‌کنند باید نسبت به نصب و استفاده از دستگاه کارتخوان اقدام کنند.

مودیان مالیاتی که میزان فروش سالانه آنها کمتر از میزان پیش‌بینی شده در ماده ۱۴ مکرر قانون پایانه‌های فروشگاهی و سامانه مودیان است از صدور صورت‌حساب الکترونیکی معاف شدند. اما استفاده از این معافیت منوط به استفاده از دستگاه کارتخوان شده است.

طبق مصوبه هیات وزیران مودیان مالیاتی می‌توانند از این معافیت استفاده نکنند و تمایل نداشتن خود به استفاده از این معافیت را از طریق کارپوشه خود به سازمان امور مالیاتی اعلام کنند.

براساس این مصوبه اگر در یک دوره میزان فروش مودی از حد نصاب تعیین شده برای معافیت از صدور صورتحساب الکترونیکی گذشت، مودی ملزم به صدور صورتحساب است و پس از آن نیز باید به صورت مرتب صورتحساب الکترونیکی را صادر کند.

البته در این مصوبه برای کسانی که از این معافیت استفاده نمی‌کنند و خرید و فروش خود را متناسب با یکدیگر و با استفاده از صورتحساب الکترونیکی انجام می‌دهند ضرایب مالیاتی‌شان متفاوت محاسبه می‌شود و اعتبار مالیاتی به آنها اختصاص می‌گیرد.

طبق ماده ۵ این مصوبه «برای مودیان معاف تا زمانی که نسبت به انصراف استفاده از معافیت اقدام ننموده‌اند مالیات و عوارض ارزش افزوده هر دوره، به شکل مشخص محاسبه می‌شود. برای مودیانی که خریدهای آنها مستند به صورتحساب‌الکترونیکی و متناسب با فروش او در آن دوره است ضرایبی برای میزان فروش با هر نرخ مالیاتی بر اساس نوع فعالیت مودی در دوره های مالیاتی یا سهم خرید با نرخ‌های مختلف مالیاتی از کل خریدهای آنها در آن دوره محاسبه می‌شود.

با ضرب این مقادیر در مقدار کل فروش مودی طی آن دوره، سهم نرخ‌های مختلف مالیاتی از کل فروش او محاسبه شده و بر این اساس مالیات و عوارض فروش مودی محاسبه می‌شود. همچنین مطابق قوانین و مقررات اعتبار قابل کسر مودی بر اساس صورت‌حساب الکترونیکی مربوط به خرید محاسبه می‌شود. بدهی مالیات بر ارزش افزوده مودی که شامل ما‌به‌التفاوت مالیات و عوارض فروش مودی و اعتبار قابل کسر او در طول دوره طبق مقررات محاسبه می‌شود.

متن کامل آیین‌نامه اجرایی ماده ۱۴ مکرر قانون پایانه‌های فروشگاهی و سامانه مودیان